Новая операция по проверке деревьев

Когда питомник Sierra Gold поставляет партию новых деревьев, компания хочет точно знать, что сорт и подвой соответствуют этикетке. Так происходит в каждом детском саду.

Недавние инвестиции в технологию скрининга ДНК и обновления процедур генетической проверки Калифорнийского университета облегчают выполнение этих обещаний таким питомникам, как Sierra Gold.

«Это единственный способ, которым мы можем работать», — сказал Рид Робинсон, главный операционный директор Sierra Gold. «Недоразумения ужасны для наших клиентов и ужасны для нас».

Как и многие питомники, Sierra Gold из Юба-Сити, Калифорния, начала использовать полимеразную цепную реакцию, или ПЦР, машины для генетического скрининга для проверки растений, полученных от селекционеров, и для двойной проверки ведения записей в своей собственной лаборатории по культуре тканей и в садах полевых деревьев.

Компания приобрела свой обычный ПЦР-аппарат, использующий гель-электрофорез, в 2017 году после того, как получила из доверенной лаборатории некоммерческий сорт вишни, ошибочно маркированный как Челан, и, сама того не зная, продала его. В 2020 году компания приобрела аппарат ПЦР в реальном времени. Когда-то эта технология в реальном времени была прерогативой только богатых исследовательских лабораторий, но теперь она выполняет 96 тестов точнее за то же время, что и предыдущая версия — 16.

«Вы получаете гораздо больше данных и гораздо более надежные данные», — сказал Мика Стивенс, менеджер исследовательской лаборатории Sierra Gold.

Тем временем система за стенами детской изменилась.

В этом году Фонд обслуживания растений Калифорнийского университета в Дэвисе начал требовать от клиентов, таких как селекционеры, питомники других университетов и, иногда, производители, которые приносят материал в лабораторию, также предоставить образец ранее проверенной ткани — «ваучер». — для сравнения ДНК, — сказал Махер Аль Руахних, директор фонда. Затем технические специалисты размножат растение, вырастят его и сравнят с ваучером. Если он совпадет, они продолжат выращивать деревья в течение как минимум двух лет для тестирования на вирус, а затем снова проверят ДНК.

Раньше фундамент тестировался только в конце процесса, иногда после того, как клиенты, с которыми они работают, уже выпустили предварительные версии.

В 2019 году фонд обнаружил ошибку, проведя анализ ДНК, и обнаружил, что некоторые подвои вишни Gisela 5 на самом деле были Gisela 6, менее карликовым вариантом, после того как материал был предварительно возвращен покупателю. К тому времени он достиг коммерческих посадок. По словам Аль Руахниха, если бы фонд использовал новый протокол, ошибка была бы обнаружена раньше.

По словам Аль Руахниха, подобные ошибки редки, но они могут случиться.

Проблема стала еще более актуальной с появлением новых сортов и увеличением спроса на тестирование яблок, груш и косточковых фруктов.

«Нам нужно работать всем вместе, чтобы избежать ошибок», — сказал Аль Руахни.

Клиенты обращаются в фонд в основном для тестирования на вирусы, но в рамках пакета они получают надежную проверку. Оба являются частью его мандата в рамках программы регистрации и сертификации лиственных фруктовых и ореховых деревьев Министерства сельского хозяйства Калифорнии. За услуги по исследованию фруктовых деревьев и виноградных лоз лаборатория взимает 355 долларов США за образец.

Это отличается от Северо-западного Центра чистых растений, расположенного на базе Университета штата Вашингтон в Проссере, который имеет право только проверять наличие болезней. Фактически, контракт лаборатории Проссера с Национальной сетью чистых растений Министерства сельского хозяйства США прямо запрещает другие тесты: «Сеть признает важность сохранения и проверки идентичности клональных растений, включая соответствие типу; однако снятие отпечатков пальцев ДНК и обеспечение точности типов работ не могут быть поддержаны этим финансированием».

В прошлом центр Проссера получал государственные средства на генотипирование виноградных лоз и использовал FPS Калифорнии для выполнения этой роли, сказал Скотт Харпер, директор центра. Лаборатория также помогла компаниям, которым требуются услуги по генотипированию, найти частную лабораторию.